不動産を担保にしているローンがあるのですが，その部分は総量規制の対象ですか？

いいえ，対象ではありません。

不動産担保貸付は，「除外の貸付」にあたるため，総量規制の対象外となります。このほかにも，担保貸付として「除外の貸付」と位置づけられているのは，自動車購入時の自動車を担保にした貸付，有価証券を担保にした貸付などです。